一、农林有害生物发生、监测和综合防治研究
    主要研究内容： 1 、农林主要病、虫、草、鼠发生、监测和综合防治研究； 2 、检疫性病虫草害研究； 3 、突发性病虫害研究； 4 、病虫草鼠防治新技术研究。

二、主要农作物品种抗性鉴定与抗源利用研究
    主要研究内容： 1 、农作物品种抗性鉴定； 2 、微生物鉴定与保存； 3 、抗源利用研究。

三、植保技术信息化的研究
    主要研究内容： 1 、植保技术信息化研究； 2 、植保技术社会化服务平台建设； 3 、植保技术零距离服务体系建立。

四、昆虫、螨类及其天敌的分类与应用研究
    主要研究内容： 1 、捕食螨种类筛选、繁殖与应用研究； 2 、天敌昆虫种类筛选、繁殖与应用研究； 3 、昆虫、螨类分类研究； 4 、昆虫、螨类资源利用研究。

五、生物源有害生物控制剂研究
    主要研究内容： 1 、生物活性物质的分离与应用研究； 2 、微生物源有害生物控制剂研究。

六、化学防治及其实负效应的监测与治理 ( 建议改为农药毒理与生态环境安全研究 )
    主要研究内容： 1 、新农药及农药使用新技术研究； 2 、病虫抗药性研究及抗性风险评估； 3 、农药残留检测与治理研究； 4 、农药毒理研究。

七、绿色食品生产技术标准研究
    主要研究内容： 1 、绿色食品生产技术标准操作规程研究和制订； 2 、食品生产安全研究； 3 、主要农作物无公害生产技术研究。

八、应用真菌研究
    主要研究内容： 1 、食（药）用菌遗传育种研究； 2 、食（药）用菌设施栽培及产期调控研究； 3 、 食（药）用菌 病虫害研究； 4 、 食（药）用菌 深加工与产品开发研究。

九、生物多样性及生物安全研究
    主要研究内容： 1 、农业生物安全性研究； 2 、生物多样性及生态恢复研究。 3 、分子微生物生态学。

十、植保生物技术研究与应用
    主要研究内容： 1 、病原分子检测； 2 、分子病理学。